Shattered Memories сохраняют идею и смысл игры 99-года, а именно поиски отца своей дочери в затерянном странном городе. Главный герой игры Гарри Мейсон потерпел аварию на автомобиле вместе с дочерью, после того как он очнулся, его дочь Шерил уже не было. Новый сюжет и так же новые и измененные персонажи с монстрами. Доступны пять окончаний. Геймплей происходит в двух частях: сеанс психотерапии, первого лица, а также чрезмерная перспектива от 3-го лица, и путешествия Гарри через Silent Hill, который периодически прерывается появлением перехода к альтернативному измерению. Ответы напсихологические тесты в сеансе терапии влияют на различные элементы геймплея в путешествии Гарри.